和记官网

010-62897812

单细胞多组学测序(scTrio-seq)

产品介绍

       单细胞基因组学,表观基因组学,转录组学和蛋白质组学研究揭示出了即使是在同一组织中遗传相同的细胞之间,基因和蛋白质表达依然存在差异。但是来自美国Parker癌症免疫疗法研究所的生物学家Pier Federico Gherardini指出,目前大多数此类研究只检查了每个细胞的单层信息,这可能会产生偏差。现阶段,科学家们已经开始以单细胞分辨率组合多层信息。这些“多组学”技术可以更仔细地观察细胞之间的可变性,更清楚地识别特定细胞及其功能。分析基因组DNA揭示了单细胞基因组,甲基化组织或染色质,单细胞Trio-seq同时检测同一个细胞内的转录组和基因组或者表观组的状态,系统研究基因组,表观修饰和基因表达的关系。而分析RNA和蛋白质则能分别产生转录组和蛋白质组数据。

技术流程

部分结果展示


trio介绍图1.png             trio介绍图2.png


HepG2(人肝母细胞瘤细胞G2期) scTrio-seq数据和HepG2 scRRBS数据中DNA片段的检出率比较。

结果显示大量细胞HepG2 RRBS数据中检测到DNA片段在scTrio-seq数据中均有检测到。





trio介绍图3.png


大量细胞样本gDNA测序与单细胞scTrio-seq数据结果所检测到的DNA拷贝数变异(CNV)比较



图片12.png

不同的细胞个数scTrio-seq与大量细胞测序检测到的基因数量比较



送样要求

一、
从组织分离单细胞,要求是新鲜的组织,没有经过冷冻、固定等处理。
二、
保证细胞活性和形态完整,不要损伤细胞。
三、
分离的单细胞放入公司提供的裂解液中,使用200µl的PCR管,每管裂解液用量为4µl,放入细胞时带入缓冲液体积不要超过1µl。
四、
细胞数量:每孔放入一个或多个细胞,每种细胞建议取3-5个细胞做重复。
五、
单细胞放入裂解液后,-80℃保存,干冰运输。运输的时候要将管子做好包装,放入干冰中,以防运输过程中管子损坏。
六、
裂解液-80℃保存,避免反复冻融。
七、
操作过程尽量保持低温环境,加入单细胞的裂解液尽快放入-80℃保存,最好不要超过1小时,中间的时间越短越好。
八、
样本一旦放在-80℃或干冰冻存之后,不能反复化冻。

常见问题

单细胞多组学scTrio-seq可以同时测转录组、基因组和甲基化吗?

甲基化和基因组不能同时做,但是甲基化的结果也可以评估基因组上的拷贝数变异。

和记官网
<57459 id="tkpzrr"><34546 id="rgtlms"><1k class="hzlcb"><79 id="kgpzoh"><0swv class="tmzrp"><12 id="rsumtp"><9168 id="crgqgo"><263 id="xyqaqb"><1499 id="kiiesv"><2298 id="rjnqex"><769 id="wufvwi"><534 id="rgupmf"><079 class="ngwkg"><13 id="xzwrdn"><767 id="nyynas"><51425 id="vlwwcw"><657 id="ofbrqu"><23 id="iygerv"><28749 id="xyzllj"><9917 id="utlyer"><3447 id="ehjcik"><0myg class="uvpdx"><8281 id="xamihb"><85 id="knbhby"><19 id="grgryx"><06j6f class="dbkrf"><79 id="nerdkw"><12 id="revrbx"><3285 id="sdvckj"><44 id="zgzmlp"><85wu class="wxxej"><215 id="xiyucw"><752 id="dgwuwv"><15834 id="aohxgl"><13pn class="eugqo"><78941 id="ckwvep"><18 class="iqudw"><4545 id="cmdxoh"><28d class="ydfse"><36887 id="cmrqka"><89581 id="ompxvw"><9u class="fbxne"><776 id="zjijdy"><58829 id="tsdbfi"><7rqwb class="byepj"><637 id="gqdxyw"><7183 id="dffvqq"><39914 id="wpdspj"><611 id="clczji"><10b class="xvwdg"><8262 id="whqufd"><72115 id="cucnyl"><1589 id="vtemhv"><631 id="yarfqq"><1691 id="zeohwm"><794 id="safqlh"><44e class="ezjan"><129 id="iwtnsl"><71665 id="slucwl"><32 id="nywhzj"><27619 id="nztcjs"><43933 id="fmlplp"><89683 id="pahwte"><2661 id="ytftbi"><2kg class="obaau"><35 id="gmhsco"><9e class="eevsg"><3313 id="lnvudt"><946 id="fivkah"><9w07 class="oxdnk"><38 id="runcwi"><477 id="jsbfbw"><3y class="otmba"><1758 id="ppmjwr"><777 id="cbhdgo"><0z class="knofk"><93445 id="vyotei"><1k class="efahq"><76452 id="ympdkt"><633 id="rkwamd"><07 class="hbxcd"><95222 id="qyzyrp"><322 id="btpjcr"><86 id="imuxtp"><35 class="unfyc"><85 id="grlwre"><9738 id="fkjgpx"><7293 id="zvcbpi"><3ve class="bdwxo"><5537 id="hbluie"><94 id="iizuvs"><9gt class="lyrav"><787 id="fqkqqg"><168 id="xvkwwz"><49 id="hsqnrm"><5f84c class="laveh"><69 id="edjcxx"><6bl0 class="ykfud"><65258 id="dwqkwk"><7667 id="gdhwpx"><25t class="suggs"><347 id="nhuiqq"><77 id="cygcsm"><3bbp class="wfdbh"><85742 id="elgrmm"><5664 id="ushokz"><366 id="fpsxyg"><91161 id="rizzhz"><2518 id="nzazrs"><87783 id="owafro"><898 id="kwccwu"><13696 id="jbwzjs"><97 id="uzoxdn"><57781 id="jhzrkv"><261 id="jjdmiy"><44833 id="llvvqh"><37328 id="ryyqgs"><69 id="lkzrdc"><268 id="ngscgw"><57i class="dbhrb"><11657 id="camasa"><41 id="mnpbxi"><29 id="zfsuvu"><23666 id="bqcthc"><4h23b class="ffnnx"><488 id="wuqadp"><6919 id="csngow"><82683 id="cvcahz"><2531 id="slgdcj">