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10x单细胞ATAC-Seq

产品介绍

单细胞测序技术发展迅速,主要是由于其能解决稀有样本测序和群体细胞异质性两个难题,且在各组学中都得到了充分地应用。近年来,将单细胞测序和ATAC测序技术进行结合,完成了单细胞测序技术的进阶,此方法具有通量高、成本低、易操作等特点,成为单细胞表观遗传学的一大突破。

10×单细胞ATAC-seq,以高分辨率研究染色质开放区域,为成千上万个单细胞提供全面的染色质调控图谱。

技术流程

部分结果展示

本文章通过对16个健康人的骨髓及外周血细胞共计63882个细胞进行10×ATAC测序分析,基于染色质开放程度,结果共鉴定出31个细胞亚群(图2左图)。且在此基础上分析了共116,713个顺式调控元件的热图(图2右图)。

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此外,还进一步对免疫细胞的表观基因组分化轨迹进行了拟时序分析。


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送样要求

一、
细胞活性:>80%,生长状态良好;
二、
细胞浓度:500-1000cell/μL;
三、
细胞总量:30万个。

常见问题

10×单细胞ATAC-seq可以测序多少个细胞?

利用可扩展的高通量解决方案,每个通道可分析50010,000个细胞。

上样到芯片上的细胞核回收率大概会有多少?

上样到芯片上的细胞核回收率高达65%左右。

10×单细胞ATAC-seq上机策略是什么?一般多大上机量可以满足分析需求?

10×单细胞ATAC-seq需要用navoseq PE50上机测序,如10000个细胞核大概需要400M reads测序量,即40G数据。

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